Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC63

GRTP1, Growth hormone-regulated TBC protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1Q5TC63 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRTP1Q5TC63 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRTP1Q5TC63 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRTP1Q5TC63 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRTP1Q5TC63 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms