Protein–RNA interactions for Protein: Q5TB30

DEPDC1, DEP domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1Q5TB30 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DEPDC1Q5TB30 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DEPDC1Q5TB30 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DEPDC1Q5TB30 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DEPDC1Q5TB30 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DEPDC1Q5TB30 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DEPDC1Q5TB30 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DEPDC1Q5TB30 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DEPDC1Q5TB30 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DEPDC1Q5TB30 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DEPDC1Q5TB30 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DEPDC1Q5TB30 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DEPDC1Q5TB30 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DEPDC1Q5TB30 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DEPDC1Q5TB30 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DEPDC1Q5TB30 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DEPDC1Q5TB30 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DEPDC1Q5TB30 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DEPDC1Q5TB30 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DEPDC1Q5TB30 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DEPDC1Q5TB30 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DEPDC1Q5TB30 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DEPDC1Q5TB30 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DEPDC1Q5TB30 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEPDC1Q5TB30 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DEPDC1Q5TB30 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DEPDC1Q5TB30 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DEPDC1Q5TB30 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DEPDC1Q5TB30 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DEPDC1Q5TB30 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DEPDC1Q5TB30 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DEPDC1Q5TB30 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms