Protein–RNA interactions for Protein: Q5T447

HECTD3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD3Q5T447 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECTD3Q5T447 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECTD3Q5T447 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECTD3Q5T447 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECTD3Q5T447 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECTD3Q5T447 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HECTD3Q5T447 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECTD3Q5T447 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HECTD3Q5T447 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HECTD3Q5T447 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECTD3Q5T447 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HECTD3Q5T447 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HECTD3Q5T447 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HECTD3Q5T447 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HECTD3Q5T447 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HECTD3Q5T447 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HECTD3Q5T447 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HECTD3Q5T447 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HECTD3Q5T447 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HECTD3Q5T447 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HECTD3Q5T447 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HECTD3Q5T447 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HECTD3Q5T447 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HECTD3Q5T447 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HECTD3Q5T447 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HECTD3Q5T447 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HECTD3Q5T447 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HECTD3Q5T447 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HECTD3Q5T447 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HECTD3Q5T447 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HECTD3Q5T447 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HECTD3Q5T447 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HECTD3Q5T447 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HECTD3Q5T447 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HECTD3Q5T447 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HECTD3Q5T447 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HECTD3Q5T447 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HECTD3Q5T447 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HECTD3Q5T447 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HECTD3Q5T447 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECTD3Q5T447 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECTD3Q5T447 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECTD3Q5T447 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECTD3Q5T447 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECTD3Q5T447 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECTD3Q5T447 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECTD3Q5T447 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HECTD3Q5T447 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HECTD3Q5T447 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HECTD3Q5T447 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HECTD3Q5T447 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HECTD3Q5T447 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HECTD3Q5T447 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HECTD3Q5T447 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HECTD3Q5T447 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HECTD3Q5T447 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HECTD3Q5T447 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HECTD3Q5T447 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HECTD3Q5T447 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECTD3Q5T447 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HECTD3Q5T447 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HECTD3Q5T447 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HECTD3Q5T447 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HECTD3Q5T447 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HECTD3Q5T447 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HECTD3Q5T447 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HECTD3Q5T447 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HECTD3Q5T447 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HECTD3Q5T447 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HECTD3Q5T447 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HECTD3Q5T447 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HECTD3Q5T447 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECTD3Q5T447 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECTD3Q5T447 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HECTD3Q5T447 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECTD3Q5T447 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECTD3Q5T447 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HECTD3Q5T447 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
HECTD3Q5T447 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 739.1 ms