Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRIF1Q5T3J3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIF1Q5T3J3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRIF1Q5T3J3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRIF1Q5T3J3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRIF1Q5T3J3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRIF1Q5T3J3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRIF1Q5T3J3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRIF1Q5T3J3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRIF1Q5T3J3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRIF1Q5T3J3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRIF1Q5T3J3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRIF1Q5T3J3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRIF1Q5T3J3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIF1Q5T3J3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIF1Q5T3J3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIF1Q5T3J3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRIF1Q5T3J3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIF1Q5T3J3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIF1Q5T3J3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIF1Q5T3J3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIF1Q5T3J3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIF1Q5T3J3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIF1Q5T3J3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIF1Q5T3J3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIF1Q5T3J3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIF1Q5T3J3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIF1Q5T3J3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIF1Q5T3J3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms