Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
HP1BP3Q5SSJ5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HP1BP3Q5SSJ5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HP1BP3Q5SSJ5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HP1BP3Q5SSJ5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HP1BP3Q5SSJ5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HP1BP3Q5SSJ5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HP1BP3Q5SSJ5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HP1BP3Q5SSJ5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HP1BP3Q5SSJ5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HP1BP3Q5SSJ5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HP1BP3Q5SSJ5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HP1BP3Q5SSJ5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HP1BP3Q5SSJ5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HP1BP3Q5SSJ5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HP1BP3Q5SSJ5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HP1BP3Q5SSJ5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HP1BP3Q5SSJ5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HP1BP3Q5SSJ5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HP1BP3Q5SSJ5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HP1BP3Q5SSJ5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HP1BP3Q5SSJ5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HP1BP3Q5SSJ5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HP1BP3Q5SSJ5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HP1BP3Q5SSJ5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HP1BP3Q5SSJ5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HP1BP3Q5SSJ5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HP1BP3Q5SSJ5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HP1BP3Q5SSJ5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HP1BP3Q5SSJ5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HP1BP3Q5SSJ5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HP1BP3Q5SSJ5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HP1BP3Q5SSJ5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms