Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNT2

TMEM201, Transmembrane protein 201, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM201Q5SNT2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM201Q5SNT2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMEM201Q5SNT2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM201Q5SNT2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms