Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SOHLH1Q5JUK2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SOHLH1Q5JUK2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOHLH1Q5JUK2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOHLH1Q5JUK2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SOHLH1Q5JUK2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOHLH1Q5JUK2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOHLH1Q5JUK2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOHLH1Q5JUK2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOHLH1Q5JUK2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOHLH1Q5JUK2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOHLH1Q5JUK2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SOHLH1Q5JUK2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOHLH1Q5JUK2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOHLH1Q5JUK2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOHLH1Q5JUK2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOHLH1Q5JUK2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOHLH1Q5JUK2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SOHLH1Q5JUK2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOHLH1Q5JUK2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOHLH1Q5JUK2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SOHLH1Q5JUK2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOHLH1Q5JUK2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOHLH1Q5JUK2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOHLH1Q5JUK2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOHLH1Q5JUK2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOHLH1Q5JUK2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOHLH1Q5JUK2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SOHLH1Q5JUK2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOHLH1Q5JUK2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOHLH1Q5JUK2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOHLH1Q5JUK2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SOHLH1Q5JUK2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms