Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HERC4Q5GLZ8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HERC4Q5GLZ8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HERC4Q5GLZ8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HERC4Q5GLZ8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HERC4Q5GLZ8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HERC4Q5GLZ8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HERC4Q5GLZ8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HERC4Q5GLZ8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HERC4Q5GLZ8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HERC4Q5GLZ8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HERC4Q5GLZ8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HERC4Q5GLZ8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HERC4Q5GLZ8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HERC4Q5GLZ8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HERC4Q5GLZ8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HERC4Q5GLZ8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HERC4Q5GLZ8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HERC4Q5GLZ8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HERC4Q5GLZ8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HERC4Q5GLZ8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HERC4Q5GLZ8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HERC4Q5GLZ8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HERC4Q5GLZ8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HERC4Q5GLZ8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HERC4Q5GLZ8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HERC4Q5GLZ8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HERC4Q5GLZ8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HERC4Q5GLZ8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HERC4Q5GLZ8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HERC4Q5GLZ8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HERC4Q5GLZ8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HERC4Q5GLZ8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HERC4Q5GLZ8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HERC4Q5GLZ8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HERC4Q5GLZ8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HERC4Q5GLZ8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HERC4Q5GLZ8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HERC4Q5GLZ8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HERC4Q5GLZ8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HERC4Q5GLZ8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HERC4Q5GLZ8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HERC4Q5GLZ8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HERC4Q5GLZ8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HERC4Q5GLZ8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HERC4Q5GLZ8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HERC4Q5GLZ8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HERC4Q5GLZ8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HERC4Q5GLZ8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HERC4Q5GLZ8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HERC4Q5GLZ8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HERC4Q5GLZ8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HERC4Q5GLZ8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HERC4Q5GLZ8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HERC4Q5GLZ8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HERC4Q5GLZ8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HERC4Q5GLZ8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HERC4Q5GLZ8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HERC4Q5GLZ8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HERC4Q5GLZ8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HERC4Q5GLZ8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HERC4Q5GLZ8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HERC4Q5GLZ8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HERC4Q5GLZ8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HERC4Q5GLZ8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HERC4Q5GLZ8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HERC4Q5GLZ8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HERC4Q5GLZ8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HERC4Q5GLZ8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HERC4Q5GLZ8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HERC4Q5GLZ8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HERC4Q5GLZ8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HERC4Q5GLZ8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HERC4Q5GLZ8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HERC4Q5GLZ8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms