Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRRT3Q5FWE3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRRT3Q5FWE3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRRT3Q5FWE3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRRT3Q5FWE3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRRT3Q5FWE3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRRT3Q5FWE3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRRT3Q5FWE3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRRT3Q5FWE3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRRT3Q5FWE3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRRT3Q5FWE3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRRT3Q5FWE3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRRT3Q5FWE3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRRT3Q5FWE3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRRT3Q5FWE3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRRT3Q5FWE3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRRT3Q5FWE3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRRT3Q5FWE3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRRT3Q5FWE3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRRT3Q5FWE3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRRT3Q5FWE3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRRT3Q5FWE3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRRT3Q5FWE3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRRT3Q5FWE3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRRT3Q5FWE3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRRT3Q5FWE3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRRT3Q5FWE3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRRT3Q5FWE3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRRT3Q5FWE3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRRT3Q5FWE3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRRT3Q5FWE3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRRT3Q5FWE3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRRT3Q5FWE3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRRT3Q5FWE3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRRT3Q5FWE3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRRT3Q5FWE3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms