Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CERKLQ49MI3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CERKLQ49MI3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CERKLQ49MI3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CERKLQ49MI3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CERKLQ49MI3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CERKLQ49MI3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CERKLQ49MI3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CERKLQ49MI3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CERKLQ49MI3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CERKLQ49MI3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CERKLQ49MI3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CERKLQ49MI3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CERKLQ49MI3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CERKLQ49MI3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CERKLQ49MI3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CERKLQ49MI3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CERKLQ49MI3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CERKLQ49MI3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CERKLQ49MI3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CERKLQ49MI3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CERKLQ49MI3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CERKLQ49MI3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CERKLQ49MI3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CERKLQ49MI3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CERKLQ49MI3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CERKLQ49MI3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CERKLQ49MI3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CERKLQ49MI3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CERKLQ49MI3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CERKLQ49MI3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CERKLQ49MI3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CERKLQ49MI3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CERKLQ49MI3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CERKLQ49MI3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CERKLQ49MI3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CERKLQ49MI3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CERKLQ49MI3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CERKLQ49MI3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CERKLQ49MI3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CERKLQ49MI3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CERKLQ49MI3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CERKLQ49MI3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CERKLQ49MI3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CERKLQ49MI3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CERKLQ49MI3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CERKLQ49MI3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CERKLQ49MI3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CERKLQ49MI3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CERKLQ49MI3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CERKLQ49MI3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CERKLQ49MI3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CERKLQ49MI3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CERKLQ49MI3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CERKLQ49MI3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CERKLQ49MI3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CERKLQ49MI3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CERKLQ49MI3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CERKLQ49MI3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CERKLQ49MI3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CERKLQ49MI3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CERKLQ49MI3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CERKLQ49MI3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CERKLQ49MI3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CERKLQ49MI3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CERKLQ49MI3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CERKLQ49MI3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CERKLQ49MI3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CERKLQ49MI3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms