Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BBS9Q3SYG4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BBS9Q3SYG4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBS9Q3SYG4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms