Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV1

NBPF20, Neuroblastoma breakpoint family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF20Q3BBV1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF20Q3BBV1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF20Q3BBV1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF20Q3BBV1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF20Q3BBV1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF20Q3BBV1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF20Q3BBV1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF20Q3BBV1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF20Q3BBV1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF20Q3BBV1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF20Q3BBV1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF20Q3BBV1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF20Q3BBV1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF20Q3BBV1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NBPF20Q3BBV1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NBPF20Q3BBV1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NBPF20Q3BBV1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NBPF20Q3BBV1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NBPF20Q3BBV1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NBPF20Q3BBV1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NBPF20Q3BBV1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NBPF20Q3BBV1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NBPF20Q3BBV1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NBPF20Q3BBV1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NBPF20Q3BBV1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF20Q3BBV1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF20Q3BBV1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF20Q3BBV1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF20Q3BBV1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF20Q3BBV1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF20Q3BBV1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF20Q3BBV1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF20Q3BBV1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF20Q3BBV1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF20Q3BBV1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF20Q3BBV1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF20Q3BBV1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF20Q3BBV1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF20Q3BBV1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF20Q3BBV1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF20Q3BBV1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF20Q3BBV1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF20Q3BBV1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF20Q3BBV1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF20Q3BBV1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF20Q3BBV1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF20Q3BBV1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF20Q3BBV1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF20Q3BBV1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF20Q3BBV1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NBPF20Q3BBV1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NBPF20Q3BBV1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NBPF20Q3BBV1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NBPF20Q3BBV1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NBPF20Q3BBV1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF20Q3BBV1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF20Q3BBV1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF20Q3BBV1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF20Q3BBV1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF20Q3BBV1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF20Q3BBV1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBPF20Q3BBV1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBPF20Q3BBV1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBPF20Q3BBV1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBPF20Q3BBV1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NBPF20Q3BBV1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NBPF20Q3BBV1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NBPF20Q3BBV1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NBPF20Q3BBV1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NBPF20Q3BBV1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBPF20Q3BBV1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBPF20Q3BBV1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBPF20Q3BBV1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBPF20Q3BBV1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBPF20Q3BBV1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NBPF20Q3BBV1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBPF20Q3BBV1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBPF20Q3BBV1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NBPF20Q3BBV1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF20Q3BBV1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF20Q3BBV1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF20Q3BBV1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF20Q3BBV1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NBPF20Q3BBV1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF20Q3BBV1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF20Q3BBV1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF20Q3BBV1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NBPF20Q3BBV1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF20Q3BBV1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF20Q3BBV1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF20Q3BBV1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF20Q3BBV1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF20Q3BBV1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF20Q3BBV1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF20Q3BBV1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF20Q3BBV1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF20Q3BBV1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF20Q3BBV1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF20Q3BBV1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF20Q3BBV1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms