Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TWISTNBQ3B726 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TWISTNBQ3B726 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TWISTNBQ3B726 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
TWISTNBQ3B726 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TWISTNBQ3B726 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TWISTNBQ3B726 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TWISTNBQ3B726 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TWISTNBQ3B726 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TWISTNBQ3B726 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
TWISTNBQ3B726 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
TWISTNBQ3B726 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
TWISTNBQ3B726 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TWISTNBQ3B726 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TWISTNBQ3B726 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
TWISTNBQ3B726 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TWISTNBQ3B726 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TWISTNBQ3B726 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TWISTNBQ3B726 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
TWISTNBQ3B726 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TWISTNBQ3B726 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TWISTNBQ3B726 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TWISTNBQ3B726 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TWISTNBQ3B726 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TWISTNBQ3B726 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TWISTNBQ3B726 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TWISTNBQ3B726 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TWISTNBQ3B726 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TWISTNBQ3B726 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TWISTNBQ3B726 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TWISTNBQ3B726 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TWISTNBQ3B726 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
TWISTNBQ3B726 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TWISTNBQ3B726 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TWISTNBQ3B726 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TWISTNBQ3B726 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TWISTNBQ3B726 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TWISTNBQ3B726 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TWISTNBQ3B726 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TWISTNBQ3B726 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TWISTNBQ3B726 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TWISTNBQ3B726 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TWISTNBQ3B726 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TWISTNBQ3B726 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TWISTNBQ3B726 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TWISTNBQ3B726 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TWISTNBQ3B726 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
TWISTNBQ3B726 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
TWISTNBQ3B726 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TWISTNBQ3B726 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TWISTNBQ3B726 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TWISTNBQ3B726 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TWISTNBQ3B726 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TWISTNBQ3B726 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TWISTNBQ3B726 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TWISTNBQ3B726 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TWISTNBQ3B726 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TWISTNBQ3B726 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
TWISTNBQ3B726 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
TWISTNBQ3B726 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TWISTNBQ3B726 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TWISTNBQ3B726 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
TWISTNBQ3B726 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TWISTNBQ3B726 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TWISTNBQ3B726 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TWISTNBQ3B726 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TWISTNBQ3B726 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TWISTNBQ3B726 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TWISTNBQ3B726 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms