Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HIST3H3Q16695 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIST3H3Q16695 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIST3H3Q16695 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIST3H3Q16695 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIST3H3Q16695 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIST3H3Q16695 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIST3H3Q16695 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIST3H3Q16695 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIST3H3Q16695 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIST3H3Q16695 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIST3H3Q16695 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIST3H3Q16695 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HIST3H3Q16695 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIST3H3Q16695 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIST3H3Q16695 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIST3H3Q16695 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIST3H3Q16695 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIST3H3Q16695 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIST3H3Q16695 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIST3H3Q16695 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIST3H3Q16695 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIST3H3Q16695 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIST3H3Q16695 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIST3H3Q16695 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HIST3H3Q16695 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HIST3H3Q16695 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HIST3H3Q16695 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HIST3H3Q16695 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
HIST3H3Q16695 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HIST3H3Q16695 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HIST3H3Q16695 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HIST3H3Q16695 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms