Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFIL3Q16649 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFIL3Q16649 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFIL3Q16649 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFIL3Q16649 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFIL3Q16649 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFIL3Q16649 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFIL3Q16649 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFIL3Q16649 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NFIL3Q16649 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFIL3Q16649 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFIL3Q16649 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFIL3Q16649 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFIL3Q16649 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFIL3Q16649 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFIL3Q16649 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFIL3Q16649 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NFIL3Q16649 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFIL3Q16649 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFIL3Q16649 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFIL3Q16649 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFIL3Q16649 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFIL3Q16649 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFIL3Q16649 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFIL3Q16649 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFIL3Q16649 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFIL3Q16649 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFIL3Q16649 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFIL3Q16649 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFIL3Q16649 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFIL3Q16649 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFIL3Q16649 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFIL3Q16649 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFIL3Q16649 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFIL3Q16649 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NFIL3Q16649 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFIL3Q16649 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFIL3Q16649 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFIL3Q16649 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFIL3Q16649 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFIL3Q16649 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFIL3Q16649 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NFIL3Q16649 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFIL3Q16649 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFIL3Q16649 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFIL3Q16649 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFIL3Q16649 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFIL3Q16649 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NFIL3Q16649 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFIL3Q16649 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NFIL3Q16649 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NFIL3Q16649 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NFIL3Q16649 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NFIL3Q16649 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
NFIL3Q16649 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NFIL3Q16649 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFIL3Q16649 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NFIL3Q16649 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NFIL3Q16649 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFIL3Q16649 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFIL3Q16649 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NFIL3Q16649 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFIL3Q16649 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFIL3Q16649 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFIL3Q16649 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFIL3Q16649 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFIL3Q16649 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NFIL3Q16649 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFIL3Q16649 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NFIL3Q16649 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFIL3Q16649 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFIL3Q16649 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFIL3Q16649 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFIL3Q16649 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFIL3Q16649 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFIL3Q16649 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFIL3Q16649 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NFIL3Q16649 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFIL3Q16649 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NFIL3Q16649 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFIL3Q16649 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFIL3Q16649 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFIL3Q16649 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NFIL3Q16649 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFIL3Q16649 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
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