Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGCAQ16586 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGCAQ16586 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGCAQ16586 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGCAQ16586 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGCAQ16586 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGCAQ16586 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGCAQ16586 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGCAQ16586 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGCAQ16586 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGCAQ16586 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGCAQ16586 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCAQ16586 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCAQ16586 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCAQ16586 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGCAQ16586 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCAQ16586 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCAQ16586 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCAQ16586 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCAQ16586 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCAQ16586 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCAQ16586 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCAQ16586 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SGCAQ16586 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCAQ16586 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SGCAQ16586 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCAQ16586 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCAQ16586 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCAQ16586 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SGCAQ16586 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGCAQ16586 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SGCAQ16586 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
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