Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC18A3Q16572 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC18A3Q16572 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
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