Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPE65Q16518 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPE65Q16518 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPE65Q16518 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPE65Q16518 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPE65Q16518 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPE65Q16518 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPE65Q16518 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPE65Q16518 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPE65Q16518 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPE65Q16518 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RPE65Q16518 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPE65Q16518 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RPE65Q16518 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPE65Q16518 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPE65Q16518 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPE65Q16518 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPE65Q16518 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RPE65Q16518 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPE65Q16518 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPE65Q16518 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RPE65Q16518 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPE65Q16518 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPE65Q16518 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPE65Q16518 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
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