Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZFHX3Q15911 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZFHX3Q15911 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZFHX3Q15911 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms