Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ALX1Q15699 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ALX1Q15699 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ALX1Q15699 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ALX1Q15699 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ALX1Q15699 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ALX1Q15699 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ALX1Q15699 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ALX1Q15699 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ALX1Q15699 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ALX1Q15699 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ALX1Q15699 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALX1Q15699 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALX1Q15699 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALX1Q15699 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALX1Q15699 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALX1Q15699 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALX1Q15699 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALX1Q15699 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALX1Q15699 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALX1Q15699 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALX1Q15699 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALX1Q15699 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALX1Q15699 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALX1Q15699 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALX1Q15699 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ALX1Q15699 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ALX1Q15699 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ALX1Q15699 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ALX1Q15699 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ALX1Q15699 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ALX1Q15699 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALX1Q15699 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALX1Q15699 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALX1Q15699 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALX1Q15699 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALX1Q15699 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALX1Q15699 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ALX1Q15699 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ALX1Q15699 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALX1Q15699 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALX1Q15699 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALX1Q15699 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALX1Q15699 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALX1Q15699 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALX1Q15699 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ALX1Q15699 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ALX1Q15699 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ALX1Q15699 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ALX1Q15699 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ALX1Q15699 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ALX1Q15699 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ALX1Q15699 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ALX1Q15699 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ALX1Q15699 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ALX1Q15699 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
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