Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF1AQ15573 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TAF1AQ15573 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TAF1AQ15573 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TAF1AQ15573 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF1AQ15573 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF1AQ15573 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF1AQ15573 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF1AQ15573 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1AQ15573 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1AQ15573 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1AQ15573 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1AQ15573 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF1AQ15573 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF1AQ15573 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF1AQ15573 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF1AQ15573 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF1AQ15573 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1AQ15573 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1AQ15573 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1AQ15573 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1AQ15573 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1AQ15573 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1AQ15573 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1AQ15573 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1AQ15573 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1AQ15573 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1AQ15573 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1AQ15573 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1AQ15573 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1AQ15573 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1AQ15573 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1AQ15573 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
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