Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIX1Q15475 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIX1Q15475 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SIX1Q15475 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SIX1Q15475 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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