Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNN3Q15417 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
CNN3Q15417 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNN3Q15417 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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