Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCM1Q15154 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCM1Q15154 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCM1Q15154 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCM1Q15154 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCM1Q15154 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCM1Q15154 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCM1Q15154 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCM1Q15154 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCM1Q15154 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PCM1Q15154 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCM1Q15154 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCM1Q15154 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PCM1Q15154 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCM1Q15154 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCM1Q15154 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCM1Q15154 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCM1Q15154 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCM1Q15154 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCM1Q15154 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCM1Q15154 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCM1Q15154 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCM1Q15154 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCM1Q15154 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCM1Q15154 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCM1Q15154 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCM1Q15154 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCM1Q15154 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms