Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCOLCEQ15113 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCOLCEQ15113 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCOLCEQ15113 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCOLCEQ15113 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCOLCEQ15113 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCOLCEQ15113 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCOLCEQ15113 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCOLCEQ15113 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCOLCEQ15113 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCOLCEQ15113 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCOLCEQ15113 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCOLCEQ15113 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCOLCEQ15113 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PCOLCEQ15113 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PCOLCEQ15113 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCOLCEQ15113 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCOLCEQ15113 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCOLCEQ15113 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCOLCEQ15113 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCOLCEQ15113 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCOLCEQ15113 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCOLCEQ15113 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCOLCEQ15113 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCOLCEQ15113 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCOLCEQ15113 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCOLCEQ15113 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCOLCEQ15113 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCOLCEQ15113 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCOLCEQ15113 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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