Protein–RNA interactions for Protein: Q15024

EXOSC7, Exosome complex component RRP42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC7Q15024 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC7Q15024 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC7Q15024 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC7Q15024 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC7Q15024 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC7Q15024 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC7Q15024 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC7Q15024 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC7Q15024 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC7Q15024 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC7Q15024 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC7Q15024 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EXOSC7Q15024 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC7Q15024 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC7Q15024 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC7Q15024 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC7Q15024 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC7Q15024 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC7Q15024 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC7Q15024 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC7Q15024 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC7Q15024 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC7Q15024 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC7Q15024 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC7Q15024 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC7Q15024 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC7Q15024 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC7Q15024 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC7Q15024 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC7Q15024 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC7Q15024 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms