Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
GAPVD1Q14C86 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
GAPVD1Q14C86 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
GAPVD1Q14C86 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
GAPVD1Q14C86 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
GAPVD1Q14C86 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
GAPVD1Q14C86 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
GAPVD1Q14C86 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
GAPVD1Q14C86 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
GAPVD1Q14C86 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
GAPVD1Q14C86 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
GAPVD1Q14C86 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.21
GAPVD1Q14C86 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
GAPVD1Q14C86 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
GAPVD1Q14C86 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
GAPVD1Q14C86 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
GAPVD1Q14C86 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
GAPVD1Q14C86 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
GAPVD1Q14C86 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
GAPVD1Q14C86 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
GAPVD1Q14C86 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
GAPVD1Q14C86 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
GAPVD1Q14C86 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
GAPVD1Q14C86 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
GAPVD1Q14C86 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
GAPVD1Q14C86 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
GAPVD1Q14C86 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
GAPVD1Q14C86 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
GAPVD1Q14C86 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
GAPVD1Q14C86 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
GAPVD1Q14C86 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
GAPVD1Q14C86 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
GAPVD1Q14C86 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
GAPVD1Q14C86 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
GAPVD1Q14C86 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
GAPVD1Q14C86 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
GAPVD1Q14C86 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
GAPVD1Q14C86 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
GAPVD1Q14C86 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
GAPVD1Q14C86 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
GAPVD1Q14C86 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
GAPVD1Q14C86 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
GAPVD1Q14C86 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
GAPVD1Q14C86 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.2■■■■■ 4.19
GAPVD1Q14C86 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
GAPVD1Q14C86 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC41.19■■■■■ 4.18
GAPVD1Q14C86 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
GAPVD1Q14C86 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
GAPVD1Q14C86 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
GAPVD1Q14C86 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC41.18■■■■■ 4.18
GAPVD1Q14C86 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
GAPVD1Q14C86 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
GAPVD1Q14C86 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
GAPVD1Q14C86 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
GAPVD1Q14C86 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
GAPVD1Q14C86 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
GAPVD1Q14C86 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
GAPVD1Q14C86 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
GAPVD1Q14C86 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
GAPVD1Q14C86 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
GAPVD1Q14C86 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC41.14■■■■■ 4.18
GAPVD1Q14C86 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
GAPVD1Q14C86 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
GAPVD1Q14C86 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
GAPVD1Q14C86 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
GAPVD1Q14C86 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
GAPVD1Q14C86 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
GAPVD1Q14C86 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
GAPVD1Q14C86 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC41.1■■■■■ 4.17
GAPVD1Q14C86 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
GAPVD1Q14C86 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
GAPVD1Q14C86 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
GAPVD1Q14C86 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
GAPVD1Q14C86 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
GAPVD1Q14C86 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
GAPVD1Q14C86 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
GAPVD1Q14C86 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
GAPVD1Q14C86 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
GAPVD1Q14C86 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
GAPVD1Q14C86 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
GAPVD1Q14C86 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
GAPVD1Q14C86 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
GAPVD1Q14C86 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
GAPVD1Q14C86 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
GAPVD1Q14C86 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
GAPVD1Q14C86 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
GAPVD1Q14C86 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
GAPVD1Q14C86 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC40.99■■■■■ 4.15
GAPVD1Q14C86 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
GAPVD1Q14C86 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
GAPVD1Q14C86 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
GAPVD1Q14C86 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
GAPVD1Q14C86 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
GAPVD1Q14C86 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
GAPVD1Q14C86 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
GAPVD1Q14C86 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
GAPVD1Q14C86 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC40.97■■■■■ 4.15
GAPVD1Q14C86 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
GAPVD1Q14C86 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
GAPVD1Q14C86 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
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