Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CNGB1Q14028 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CNGB1Q14028 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CNGB1Q14028 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CNGB1Q14028 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CNGB1Q14028 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CNGB1Q14028 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CNGB1Q14028 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CNGB1Q14028 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CNGB1Q14028 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CNGB1Q14028 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CNGB1Q14028 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CNGB1Q14028 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CNGB1Q14028 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CNGB1Q14028 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CNGB1Q14028 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CNGB1Q14028 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CNGB1Q14028 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CNGB1Q14028 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CNGB1Q14028 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CNGB1Q14028 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CNGB1Q14028 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CNGB1Q14028 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CNGB1Q14028 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CNGB1Q14028 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CNGB1Q14028 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CNGB1Q14028 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CNGB1Q14028 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CNGB1Q14028 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CNGB1Q14028 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CNGB1Q14028 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CNGB1Q14028 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CNGB1Q14028 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CNGB1Q14028 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CNGB1Q14028 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CNGB1Q14028 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CNGB1Q14028 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CNGB1Q14028 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CNGB1Q14028 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CNGB1Q14028 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CNGB1Q14028 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CNGB1Q14028 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CNGB1Q14028 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CNGB1Q14028 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
CNGB1Q14028 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CNGB1Q14028 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CNGB1Q14028 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
CNGB1Q14028 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CNGB1Q14028 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CNGB1Q14028 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CNGB1Q14028 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CNGB1Q14028 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CNGB1Q14028 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CNGB1Q14028 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CNGB1Q14028 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CNGB1Q14028 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CNGB1Q14028 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CNGB1Q14028 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CNGB1Q14028 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CNGB1Q14028 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CNGB1Q14028 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CNGB1Q14028 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CNGB1Q14028 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CNGB1Q14028 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CNGB1Q14028 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CNGB1Q14028 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CNGB1Q14028 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CNGB1Q14028 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CNGB1Q14028 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CNGB1Q14028 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CNGB1Q14028 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CNGB1Q14028 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CNGB1Q14028 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CNGB1Q14028 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CNGB1Q14028 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CNGB1Q14028 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CNGB1Q14028 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CNGB1Q14028 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CNGB1Q14028 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CNGB1Q14028 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CNGB1Q14028 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CNGB1Q14028 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CNGB1Q14028 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CNGB1Q14028 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CNGB1Q14028 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CNGB1Q14028 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CNGB1Q14028 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CNGB1Q14028 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CNGB1Q14028 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CNGB1Q14028 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CNGB1Q14028 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CNGB1Q14028 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CNGB1Q14028 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CNGB1Q14028 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CNGB1Q14028 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CNGB1Q14028 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CNGB1Q14028 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CNGB1Q14028 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CNGB1Q14028 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
CNGB1Q14028 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
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