Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAPGEF1Q13905 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAPGEF1Q13905 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAPGEF1Q13905 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAPGEF1Q13905 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAPGEF1Q13905 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAPGEF1Q13905 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAPGEF1Q13905 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAPGEF1Q13905 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAPGEF1Q13905 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAPGEF1Q13905 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAPGEF1Q13905 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAPGEF1Q13905 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAPGEF1Q13905 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAPGEF1Q13905 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RAPGEF1Q13905 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAPGEF1Q13905 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAPGEF1Q13905 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
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