Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EXOSC2Q13868 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC2Q13868 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
EXOSC2Q13868 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXOSC2Q13868 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
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