Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNFAIP1Q13829 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNFAIP1Q13829 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNFAIP1Q13829 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNFAIP1Q13829 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNFAIP1Q13829 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNFAIP1Q13829 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNFAIP1Q13829 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNFAIP1Q13829 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNFAIP1Q13829 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNFAIP1Q13829 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNFAIP1Q13829 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNFAIP1Q13829 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNFAIP1Q13829 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNFAIP1Q13829 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNFAIP1Q13829 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNFAIP1Q13829 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNFAIP1Q13829 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNFAIP1Q13829 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TNFAIP1Q13829 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNFAIP1Q13829 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNFAIP1Q13829 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNFAIP1Q13829 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNFAIP1Q13829 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNFAIP1Q13829 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNFAIP1Q13829 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNFAIP1Q13829 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNFAIP1Q13829 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNFAIP1Q13829 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNFAIP1Q13829 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNFAIP1Q13829 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNFAIP1Q13829 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNFAIP1Q13829 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNFAIP1Q13829 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNFAIP1Q13829 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNFAIP1Q13829 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNFAIP1Q13829 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TNFAIP1Q13829 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNFAIP1Q13829 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNFAIP1Q13829 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNFAIP1Q13829 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNFAIP1Q13829 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNFAIP1Q13829 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNFAIP1Q13829 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNFAIP1Q13829 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TNFAIP1Q13829 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNFAIP1Q13829 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNFAIP1Q13829 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNFAIP1Q13829 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNFAIP1Q13829 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNFAIP1Q13829 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNFAIP1Q13829 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNFAIP1Q13829 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNFAIP1Q13829 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNFAIP1Q13829 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNFAIP1Q13829 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNFAIP1Q13829 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNFAIP1Q13829 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TNFAIP1Q13829 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNFAIP1Q13829 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNFAIP1Q13829 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNFAIP1Q13829 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TNFAIP1Q13829 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNFAIP1Q13829 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNFAIP1Q13829 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TNFAIP1Q13829 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
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