Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PKD2Q13563 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PKD2Q13563 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
PKD2Q13563 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PKD2Q13563 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PKD2Q13563 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PKD2Q13563 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PKD2Q13563 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PKD2Q13563 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PKD2Q13563 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PKD2Q13563 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PKD2Q13563 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PKD2Q13563 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PKD2Q13563 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PKD2Q13563 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PKD2Q13563 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PKD2Q13563 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PKD2Q13563 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
PKD2Q13563 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PKD2Q13563 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PKD2Q13563 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PKD2Q13563 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PKD2Q13563 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PKD2Q13563 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PKD2Q13563 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PKD2Q13563 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PKD2Q13563 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PKD2Q13563 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PKD2Q13563 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PKD2Q13563 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PKD2Q13563 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
PKD2Q13563 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PKD2Q13563 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PKD2Q13563 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PKD2Q13563 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PKD2Q13563 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PKD2Q13563 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PKD2Q13563 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PKD2Q13563 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PKD2Q13563 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PKD2Q13563 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PKD2Q13563 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PKD2Q13563 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PKD2Q13563 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
PKD2Q13563 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PKD2Q13563 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PKD2Q13563 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PKD2Q13563 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PKD2Q13563 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PKD2Q13563 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PKD2Q13563 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PKD2Q13563 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PKD2Q13563 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PKD2Q13563 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PKD2Q13563 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PKD2Q13563 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PKD2Q13563 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PKD2Q13563 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
PKD2Q13563 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PKD2Q13563 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
PKD2Q13563 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PKD2Q13563 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PKD2Q13563 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PKD2Q13563 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PKD2Q13563 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
PKD2Q13563 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
PKD2Q13563 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
PKD2Q13563 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PKD2Q13563 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PKD2Q13563 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PKD2Q13563 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PKD2Q13563 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
PKD2Q13563 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PKD2Q13563 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PKD2Q13563 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PKD2Q13563 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PKD2Q13563 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PKD2Q13563 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PKD2Q13563 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PKD2Q13563 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PKD2Q13563 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PKD2Q13563 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PKD2Q13563 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PKD2Q13563 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PKD2Q13563 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PKD2Q13563 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PKD2Q13563 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PKD2Q13563 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PKD2Q13563 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PKD2Q13563 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PKD2Q13563 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PKD2Q13563 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PKD2Q13563 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PKD2Q13563 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
PKD2Q13563 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PKD2Q13563 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PKD2Q13563 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PKD2Q13563 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PKD2Q13563 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
PKD2Q13563 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
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