Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB3Q13509 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBB3Q13509 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB3Q13509 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB3Q13509 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB3Q13509 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB3Q13509 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB3Q13509 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB3Q13509 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB3Q13509 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBB3Q13509 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBB3Q13509 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBB3Q13509 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TUBB3Q13509 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms