Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PICALMQ13492 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PICALMQ13492 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PICALMQ13492 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PICALMQ13492 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PICALMQ13492 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PICALMQ13492 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PICALMQ13492 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PICALMQ13492 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PICALMQ13492 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PICALMQ13492 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PICALMQ13492 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PICALMQ13492 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PICALMQ13492 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PICALMQ13492 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PICALMQ13492 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PICALMQ13492 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PICALMQ13492 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PICALMQ13492 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PICALMQ13492 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PICALMQ13492 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PICALMQ13492 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PICALMQ13492 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PICALMQ13492 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PICALMQ13492 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PICALMQ13492 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PICALMQ13492 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PICALMQ13492 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PICALMQ13492 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PICALMQ13492 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PICALMQ13492 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PICALMQ13492 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PICALMQ13492 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PICALMQ13492 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PICALMQ13492 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PICALMQ13492 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PICALMQ13492 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PICALMQ13492 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PICALMQ13492 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PICALMQ13492 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PICALMQ13492 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PICALMQ13492 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PICALMQ13492 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PICALMQ13492 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PICALMQ13492 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PICALMQ13492 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PICALMQ13492 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PICALMQ13492 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PICALMQ13492 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PICALMQ13492 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PICALMQ13492 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PICALMQ13492 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PICALMQ13492 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PICALMQ13492 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PICALMQ13492 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PICALMQ13492 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PICALMQ13492 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PICALMQ13492 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PICALMQ13492 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PICALMQ13492 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PICALMQ13492 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PICALMQ13492 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PICALMQ13492 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PICALMQ13492 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PICALMQ13492 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
PICALMQ13492 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PICALMQ13492 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PICALMQ13492 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PICALMQ13492 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PICALMQ13492 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PICALMQ13492 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PICALMQ13492 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PICALMQ13492 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PICALMQ13492 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PICALMQ13492 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PICALMQ13492 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PICALMQ13492 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PICALMQ13492 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PICALMQ13492 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PICALMQ13492 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PICALMQ13492 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PICALMQ13492 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PICALMQ13492 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PICALMQ13492 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PICALMQ13492 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PICALMQ13492 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PICALMQ13492 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PICALMQ13492 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PICALMQ13492 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PICALMQ13492 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PICALMQ13492 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PICALMQ13492 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PICALMQ13492 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PICALMQ13492 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PICALMQ13492 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PICALMQ13492 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PICALMQ13492 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PICALMQ13492 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PICALMQ13492 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PICALMQ13492 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
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