Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
FOXE3Q13461 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXE3Q13461 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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