Protein–RNA interactions for Protein: Q13454

TUSC3, Tumor suppressor candidate 3, humanhuman

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC3Q13454 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUSC3Q13454 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUSC3Q13454 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TUSC3Q13454 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUSC3Q13454 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TUSC3Q13454 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUSC3Q13454 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUSC3Q13454 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUSC3Q13454 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUSC3Q13454 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUSC3Q13454 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUSC3Q13454 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUSC3Q13454 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUSC3Q13454 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUSC3Q13454 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUSC3Q13454 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUSC3Q13454 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUSC3Q13454 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUSC3Q13454 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUSC3Q13454 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TUSC3Q13454 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUSC3Q13454 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUSC3Q13454 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TUSC3Q13454 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUSC3Q13454 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TUSC3Q13454 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUSC3Q13454 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUSC3Q13454 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUSC3Q13454 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUSC3Q13454 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUSC3Q13454 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TUSC3Q13454 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUSC3Q13454 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUSC3Q13454 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUSC3Q13454 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUSC3Q13454 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TUSC3Q13454 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUSC3Q13454 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUSC3Q13454 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUSC3Q13454 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUSC3Q13454 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUSC3Q13454 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUSC3Q13454 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUSC3Q13454 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUSC3Q13454 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUSC3Q13454 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUSC3Q13454 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUSC3Q13454 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUSC3Q13454 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUSC3Q13454 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUSC3Q13454 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUSC3Q13454 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUSC3Q13454 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUSC3Q13454 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TUSC3Q13454 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TUSC3Q13454 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TUSC3Q13454 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUSC3Q13454 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUSC3Q13454 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUSC3Q13454 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUSC3Q13454 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUSC3Q13454 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUSC3Q13454 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUSC3Q13454 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TUSC3Q13454 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUSC3Q13454 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUSC3Q13454 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUSC3Q13454 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUSC3Q13454 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TUSC3Q13454 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUSC3Q13454 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUSC3Q13454 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUSC3Q13454 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUSC3Q13454 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUSC3Q13454 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUSC3Q13454 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUSC3Q13454 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUSC3Q13454 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUSC3Q13454 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TUSC3Q13454 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUSC3Q13454 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUSC3Q13454 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUSC3Q13454 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUSC3Q13454 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUSC3Q13454 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUSC3Q13454 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TUSC3Q13454 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUSC3Q13454 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUSC3Q13454 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TUSC3Q13454 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUSC3Q13454 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUSC3Q13454 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUSC3Q13454 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUSC3Q13454 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUSC3Q13454 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TUSC3Q13454 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUSC3Q13454 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUSC3Q13454 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUSC3Q13454 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUSC3Q13454 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
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