Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
UBE2V1Q13404 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2V1Q13404 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
UBE2V1Q13404 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE2V1Q13404 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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