Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PAPPAQ13219 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PAPPAQ13219 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PAPPAQ13219 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PAPPAQ13219 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PAPPAQ13219 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PAPPAQ13219 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PAPPAQ13219 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PAPPAQ13219 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PAPPAQ13219 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PAPPAQ13219 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PAPPAQ13219 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PAPPAQ13219 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PAPPAQ13219 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PAPPAQ13219 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PAPPAQ13219 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PAPPAQ13219 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PAPPAQ13219 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PAPPAQ13219 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PAPPAQ13219 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PAPPAQ13219 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PAPPAQ13219 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PAPPAQ13219 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PAPPAQ13219 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PAPPAQ13219 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PAPPAQ13219 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PAPPAQ13219 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PAPPAQ13219 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PAPPAQ13219 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PAPPAQ13219 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PAPPAQ13219 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PAPPAQ13219 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PAPPAQ13219 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PAPPAQ13219 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PAPPAQ13219 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PAPPAQ13219 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PAPPAQ13219 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PAPPAQ13219 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PAPPAQ13219 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PAPPAQ13219 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PAPPAQ13219 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PAPPAQ13219 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PAPPAQ13219 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PAPPAQ13219 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PAPPAQ13219 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PAPPAQ13219 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PAPPAQ13219 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PAPPAQ13219 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PAPPAQ13219 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PAPPAQ13219 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PAPPAQ13219 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PAPPAQ13219 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PAPPAQ13219 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PAPPAQ13219 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PAPPAQ13219 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PAPPAQ13219 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PAPPAQ13219 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PAPPAQ13219 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PAPPAQ13219 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PAPPAQ13219 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PAPPAQ13219 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
PAPPAQ13219 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PAPPAQ13219 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PAPPAQ13219 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PAPPAQ13219 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
PAPPAQ13219 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PAPPAQ13219 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PAPPAQ13219 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PAPPAQ13219 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PAPPAQ13219 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PAPPAQ13219 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PAPPAQ13219 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PAPPAQ13219 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PAPPAQ13219 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PAPPAQ13219 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PAPPAQ13219 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PAPPAQ13219 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PAPPAQ13219 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PAPPAQ13219 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PAPPAQ13219 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PAPPAQ13219 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PAPPAQ13219 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PAPPAQ13219 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PAPPAQ13219 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PAPPAQ13219 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PAPPAQ13219 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
PAPPAQ13219 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
PAPPAQ13219 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PAPPAQ13219 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PAPPAQ13219 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PAPPAQ13219 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
PAPPAQ13219 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PAPPAQ13219 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
PAPPAQ13219 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PAPPAQ13219 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PAPPAQ13219 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PAPPAQ13219 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PAPPAQ13219 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PAPPAQ13219 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PAPPAQ13219 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
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