Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTP4A2Q12974 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTP4A2Q12974 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTP4A2Q12974 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTP4A2Q12974 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTP4A2Q12974 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTP4A2Q12974 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTP4A2Q12974 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTP4A2Q12974 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTP4A2Q12974 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTP4A2Q12974 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTP4A2Q12974 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTP4A2Q12974 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTP4A2Q12974 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTP4A2Q12974 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTP4A2Q12974 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTP4A2Q12974 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTP4A2Q12974 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTP4A2Q12974 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTP4A2Q12974 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTP4A2Q12974 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTP4A2Q12974 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTP4A2Q12974 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTP4A2Q12974 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTP4A2Q12974 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTP4A2Q12974 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTP4A2Q12974 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTP4A2Q12974 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTP4A2Q12974 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTP4A2Q12974 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTP4A2Q12974 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTP4A2Q12974 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
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