Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
TROQ12816 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
TROQ12816 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
TROQ12816 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
TROQ12816 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
TROQ12816 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
TROQ12816 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
TROQ12816 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
TROQ12816 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
TROQ12816 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
TROQ12816 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
TROQ12816 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TROQ12816 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TROQ12816 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TROQ12816 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TROQ12816 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TROQ12816 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TROQ12816 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TROQ12816 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TROQ12816 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TROQ12816 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TROQ12816 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC38.34■■■■□ 3.73
TROQ12816 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
TROQ12816 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
TROQ12816 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
TROQ12816 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
TROQ12816 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
TROQ12816 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
TROQ12816 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TROQ12816 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TROQ12816 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TROQ12816 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TROQ12816 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
TROQ12816 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
TROQ12816 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
TROQ12816 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
TROQ12816 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
TROQ12816 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
TROQ12816 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
TROQ12816 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
TROQ12816 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
TROQ12816 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
TROQ12816 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
TROQ12816 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
TROQ12816 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
TROQ12816 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC38.25■■■■□ 3.71
TROQ12816 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
TROQ12816 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TROQ12816 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TROQ12816 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
TROQ12816 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
TROQ12816 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
TROQ12816 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
TROQ12816 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
TROQ12816 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
TROQ12816 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TROQ12816 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TROQ12816 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
TROQ12816 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TROQ12816 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
TROQ12816 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
TROQ12816 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
TROQ12816 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
TROQ12816 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
TROQ12816 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
TROQ12816 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
TROQ12816 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
TROQ12816 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
TROQ12816 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
TROQ12816 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
TROQ12816 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
TROQ12816 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
TROQ12816 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
TROQ12816 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
TROQ12816 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
TROQ12816 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
TROQ12816 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
TROQ12816 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
TROQ12816 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
TROQ12816 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
TROQ12816 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
TROQ12816 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC38.18■■■■□ 3.7
TROQ12816 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
TROQ12816 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
TROQ12816 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
TROQ12816 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
TROQ12816 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
TROQ12816 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
TROQ12816 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
TROQ12816 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
TROQ12816 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
TROQ12816 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
TROQ12816 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
TROQ12816 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
TROQ12816 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
TROQ12816 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
TROQ12816 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
TROQ12816 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
TROQ12816 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TROQ12816 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
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