Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TWF1Q12792 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TWF1Q12792 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TWF1Q12792 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TWF1Q12792 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TWF1Q12792 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TWF1Q12792 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TWF1Q12792 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TWF1Q12792 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TWF1Q12792 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TWF1Q12792 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TWF1Q12792 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TWF1Q12792 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TWF1Q12792 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TWF1Q12792 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TWF1Q12792 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TWF1Q12792 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TWF1Q12792 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TWF1Q12792 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TWF1Q12792 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TWF1Q12792 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TWF1Q12792 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TWF1Q12792 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TWF1Q12792 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TWF1Q12792 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TWF1Q12792 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TWF1Q12792 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TWF1Q12792 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TWF1Q12792 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TWF1Q12792 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TWF1Q12792 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TWF1Q12792 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TWF1Q12792 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TWF1Q12792 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TWF1Q12792 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TWF1Q12792 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TWF1Q12792 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TWF1Q12792 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TWF1Q12792 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TWF1Q12792 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TWF1Q12792 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TWF1Q12792 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TWF1Q12792 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TWF1Q12792 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TWF1Q12792 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TWF1Q12792 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TWF1Q12792 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TWF1Q12792 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TWF1Q12792 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TWF1Q12792 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TWF1Q12792 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TWF1Q12792 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TWF1Q12792 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TWF1Q12792 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TWF1Q12792 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TWF1Q12792 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TWF1Q12792 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TWF1Q12792 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TWF1Q12792 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TWF1Q12792 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TWF1Q12792 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TWF1Q12792 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TWF1Q12792 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TWF1Q12792 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TWF1Q12792 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TWF1Q12792 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TWF1Q12792 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TWF1Q12792 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TWF1Q12792 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TWF1Q12792 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TWF1Q12792 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TWF1Q12792 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TWF1Q12792 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TWF1Q12792 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TWF1Q12792 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TWF1Q12792 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TWF1Q12792 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TWF1Q12792 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TWF1Q12792 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TWF1Q12792 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TWF1Q12792 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TWF1Q12792 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TWF1Q12792 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TWF1Q12792 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TWF1Q12792 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TWF1Q12792 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TWF1Q12792 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TWF1Q12792 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TWF1Q12792 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TWF1Q12792 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TWF1Q12792 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TWF1Q12792 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TWF1Q12792 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TWF1Q12792 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TWF1Q12792 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TWF1Q12792 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TWF1Q12792 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TWF1Q12792 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TWF1Q12792 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms