Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXO1Q12778 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXO1Q12778 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXO1Q12778 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO1Q12778 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO1Q12778 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO1Q12778 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO1Q12778 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO1Q12778 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO1Q12778 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO1Q12778 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO1Q12778 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO1Q12778 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO1Q12778 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO1Q12778 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO1Q12778 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO1Q12778 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO1Q12778 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO1Q12778 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO1Q12778 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO1Q12778 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO1Q12778 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO1Q12778 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO1Q12778 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO1Q12778 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO1Q12778 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO1Q12778 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO1Q12778 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO1Q12778 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO1Q12778 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO1Q12778 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXO1Q12778 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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