Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.58
ARHGEF5Q12774 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
ARHGEF5Q12774 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
ARHGEF5Q12774 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
ARHGEF5Q12774 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
ARHGEF5Q12774 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
ARHGEF5Q12774 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
ARHGEF5Q12774 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
ARHGEF5Q12774 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
ARHGEF5Q12774 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ARHGEF5Q12774 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ARHGEF5Q12774 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
ARHGEF5Q12774 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ARHGEF5Q12774 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
ARHGEF5Q12774 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ARHGEF5Q12774 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ARHGEF5Q12774 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
ARHGEF5Q12774 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
ARHGEF5Q12774 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
ARHGEF5Q12774 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
ARHGEF5Q12774 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
ARHGEF5Q12774 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
ARHGEF5Q12774 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC37.34■■■■□ 3.57
ARHGEF5Q12774 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
ARHGEF5Q12774 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
ARHGEF5Q12774 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
ARHGEF5Q12774 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ARHGEF5Q12774 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ARHGEF5Q12774 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ARHGEF5Q12774 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ARHGEF5Q12774 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ARHGEF5Q12774 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ARHGEF5Q12774 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ARHGEF5Q12774 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ARHGEF5Q12774 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ARHGEF5Q12774 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ARHGEF5Q12774 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
ARHGEF5Q12774 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ARHGEF5Q12774 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ARHGEF5Q12774 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ARHGEF5Q12774 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ARHGEF5Q12774 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ARHGEF5Q12774 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ARHGEF5Q12774 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ARHGEF5Q12774 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
ARHGEF5Q12774 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ARHGEF5Q12774 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ARHGEF5Q12774 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ARHGEF5Q12774 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ARHGEF5Q12774 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ARHGEF5Q12774 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ARHGEF5Q12774 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ARHGEF5Q12774 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ARHGEF5Q12774 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ARHGEF5Q12774 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ARHGEF5Q12774 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ARHGEF5Q12774 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ARHGEF5Q12774 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ARHGEF5Q12774 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ARHGEF5Q12774 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ARHGEF5Q12774 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ARHGEF5Q12774 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ARHGEF5Q12774 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
ARHGEF5Q12774 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
ARHGEF5Q12774 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ARHGEF5Q12774 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
ARHGEF5Q12774 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
ARHGEF5Q12774 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ARHGEF5Q12774 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ARHGEF5Q12774 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ARHGEF5Q12774 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ARHGEF5Q12774 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ARHGEF5Q12774 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
ARHGEF5Q12774 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ARHGEF5Q12774 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ARHGEF5Q12774 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ARHGEF5Q12774 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ARHGEF5Q12774 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ARHGEF5Q12774 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
ARHGEF5Q12774 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC37.17■■■■□ 3.54
ARHGEF5Q12774 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
ARHGEF5Q12774 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
ARHGEF5Q12774 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ARHGEF5Q12774 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
ARHGEF5Q12774 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ARHGEF5Q12774 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
ARHGEF5Q12774 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
ARHGEF5Q12774 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ARHGEF5Q12774 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ARHGEF5Q12774 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ARHGEF5Q12774 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ARHGEF5Q12774 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ARHGEF5Q12774 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
ARHGEF5Q12774 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ARHGEF5Q12774 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
ARHGEF5Q12774 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
ARHGEF5Q12774 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
ARHGEF5Q12774 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
ARHGEF5Q12774 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
ARHGEF5Q12774 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
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