Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBBP4Q09028 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBBP4Q09028 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBBP4Q09028 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms