Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
GOLGA3Q08378 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
GOLGA3Q08378 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
GOLGA3Q08378 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
GOLGA3Q08378 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
GOLGA3Q08378 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
GOLGA3Q08378 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
GOLGA3Q08378 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
GOLGA3Q08378 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
GOLGA3Q08378 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
GOLGA3Q08378 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
GOLGA3Q08378 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.05
GOLGA3Q08378 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
GOLGA3Q08378 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
GOLGA3Q08378 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC40.32■■■■■ 4.04
GOLGA3Q08378 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
GOLGA3Q08378 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
GOLGA3Q08378 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
GOLGA3Q08378 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
GOLGA3Q08378 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
GOLGA3Q08378 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
GOLGA3Q08378 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
GOLGA3Q08378 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
GOLGA3Q08378 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
GOLGA3Q08378 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
GOLGA3Q08378 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
GOLGA3Q08378 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
GOLGA3Q08378 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
GOLGA3Q08378 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
GOLGA3Q08378 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
GOLGA3Q08378 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
GOLGA3Q08378 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC40.27■■■■■ 4.04
GOLGA3Q08378 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
GOLGA3Q08378 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
GOLGA3Q08378 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
GOLGA3Q08378 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
GOLGA3Q08378 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
GOLGA3Q08378 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
GOLGA3Q08378 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
GOLGA3Q08378 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
GOLGA3Q08378 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
GOLGA3Q08378 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
GOLGA3Q08378 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
GOLGA3Q08378 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
GOLGA3Q08378 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
GOLGA3Q08378 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
GOLGA3Q08378 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
GOLGA3Q08378 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
GOLGA3Q08378 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
GOLGA3Q08378 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
GOLGA3Q08378 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
GOLGA3Q08378 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
GOLGA3Q08378 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
GOLGA3Q08378 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
GOLGA3Q08378 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC40.19■■■■■ 4.03
GOLGA3Q08378 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
GOLGA3Q08378 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
GOLGA3Q08378 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC40.19■■■■■ 4.02
GOLGA3Q08378 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
GOLGA3Q08378 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
GOLGA3Q08378 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
GOLGA3Q08378 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
GOLGA3Q08378 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
GOLGA3Q08378 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
GOLGA3Q08378 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
GOLGA3Q08378 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
GOLGA3Q08378 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
GOLGA3Q08378 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
GOLGA3Q08378 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
GOLGA3Q08378 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
GOLGA3Q08378 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
GOLGA3Q08378 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC40.15■■■■■ 4.02
GOLGA3Q08378 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
GOLGA3Q08378 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
GOLGA3Q08378 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.02
GOLGA3Q08378 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
GOLGA3Q08378 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
GOLGA3Q08378 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
GOLGA3Q08378 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
GOLGA3Q08378 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
GOLGA3Q08378 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
GOLGA3Q08378 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
GOLGA3Q08378 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
GOLGA3Q08378 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
GOLGA3Q08378 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
GOLGA3Q08378 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
GOLGA3Q08378 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
GOLGA3Q08378 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
GOLGA3Q08378 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
GOLGA3Q08378 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
GOLGA3Q08378 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
GOLGA3Q08378 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
GOLGA3Q08378 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
GOLGA3Q08378 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
GOLGA3Q08378 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
GOLGA3Q08378 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
GOLGA3Q08378 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
GOLGA3Q08378 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
GOLGA3Q08378 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC40.07■■■■■ 4
GOLGA3Q08378 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms