Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPP3CAQ08209 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPP3CAQ08209 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPP3CAQ08209 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP3CAQ08209 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP3CAQ08209 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP3CAQ08209 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP3CAQ08209 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP3CAQ08209 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP3CAQ08209 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP3CAQ08209 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP3CAQ08209 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP3CAQ08209 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP3CAQ08209 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP3CAQ08209 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP3CAQ08209 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP3CAQ08209 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPP3CAQ08209 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPP3CAQ08209 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPP3CAQ08209 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PPP3CAQ08209 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPP3CAQ08209 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPP3CAQ08209 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPP3CAQ08209 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPP3CAQ08209 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPP3CAQ08209 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPP3CAQ08209 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPP3CAQ08209 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPP3CAQ08209 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPP3CAQ08209 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPP3CAQ08209 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPP3CAQ08209 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPP3CAQ08209 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPP3CAQ08209 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPP3CAQ08209 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PPP3CAQ08209 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPP3CAQ08209 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPP3CAQ08209 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPP3CAQ08209 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPP3CAQ08209 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPP3CAQ08209 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPP3CAQ08209 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPP3CAQ08209 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPP3CAQ08209 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPP3CAQ08209 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPP3CAQ08209 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPP3CAQ08209 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPP3CAQ08209 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPP3CAQ08209 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPP3CAQ08209 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPP3CAQ08209 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPP3CAQ08209 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPP3CAQ08209 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPP3CAQ08209 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PPP3CAQ08209 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPP3CAQ08209 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPP3CAQ08209 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPP3CAQ08209 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPP3CAQ08209 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPP3CAQ08209 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPP3CAQ08209 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPP3CAQ08209 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PPP3CAQ08209 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPP3CAQ08209 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPP3CAQ08209 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPP3CAQ08209 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPP3CAQ08209 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPP3CAQ08209 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPP3CAQ08209 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPP3CAQ08209 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PPP3CAQ08209 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPP3CAQ08209 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPP3CAQ08209 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPP3CAQ08209 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPP3CAQ08209 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPP3CAQ08209 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPP3CAQ08209 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPP3CAQ08209 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPP3CAQ08209 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPP3CAQ08209 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPP3CAQ08209 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPP3CAQ08209 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPP3CAQ08209 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPP3CAQ08209 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPP3CAQ08209 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPP3CAQ08209 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPP3CAQ08209 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPP3CAQ08209 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPP3CAQ08209 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPP3CAQ08209 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PPP3CAQ08209 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPP3CAQ08209 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPP3CAQ08209 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPP3CAQ08209 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPP3CAQ08209 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPP3CAQ08209 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPP3CAQ08209 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPP3CAQ08209 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPP3CAQ08209 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPP3CAQ08209 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms