Protein–RNA interactions for Protein: Q07020

RPL18, 60S ribosomal protein L18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18Q07020 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL18Q07020 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL18Q07020 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL18Q07020 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL18Q07020 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL18Q07020 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL18Q07020 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL18Q07020 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL18Q07020 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL18Q07020 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL18Q07020 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL18Q07020 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL18Q07020 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL18Q07020 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL18Q07020 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL18Q07020 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL18Q07020 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL18Q07020 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL18Q07020 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL18Q07020 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL18Q07020 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL18Q07020 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL18Q07020 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL18Q07020 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL18Q07020 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL18Q07020 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL18Q07020 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL18Q07020 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL18Q07020 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms