Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFHR1Q03591 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CFHR1Q03591 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFHR1Q03591 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFHR1Q03591 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFHR1Q03591 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CFHR1Q03591 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFHR1Q03591 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFHR1Q03591 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CFHR1Q03591 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CFHR1Q03591 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFHR1Q03591 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFHR1Q03591 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFHR1Q03591 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFHR1Q03591 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFHR1Q03591 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFHR1Q03591 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFHR1Q03591 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFHR1Q03591 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFHR1Q03591 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFHR1Q03591 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFHR1Q03591 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFHR1Q03591 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFHR1Q03591 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CFHR1Q03591 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFHR1Q03591 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFHR1Q03591 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CFHR1Q03591 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFHR1Q03591 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms