Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCNT1Q02742 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCNT1Q02742 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCNT1Q02742 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCNT1Q02742 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCNT1Q02742 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCNT1Q02742 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCNT1Q02742 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCNT1Q02742 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCNT1Q02742 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCNT1Q02742 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCNT1Q02742 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCNT1Q02742 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCNT1Q02742 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GCNT1Q02742 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCNT1Q02742 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCNT1Q02742 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCNT1Q02742 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GCNT1Q02742 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GCNT1Q02742 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GCNT1Q02742 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GCNT1Q02742 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GCNT1Q02742 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GCNT1Q02742 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GCNT1Q02742 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GCNT1Q02742 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GCNT1Q02742 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
GCNT1Q02742 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GCNT1Q02742 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCNT1Q02742 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCNT1Q02742 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCNT1Q02742 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCNT1Q02742 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCNT1Q02742 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCNT1Q02742 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCNT1Q02742 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GCNT1Q02742 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCNT1Q02742 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCNT1Q02742 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCNT1Q02742 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCNT1Q02742 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCNT1Q02742 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCNT1Q02742 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCNT1Q02742 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCNT1Q02742 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCNT1Q02742 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCNT1Q02742 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCNT1Q02742 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCNT1Q02742 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GCNT1Q02742 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GCNT1Q02742 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GCNT1Q02742 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCNT1Q02742 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCNT1Q02742 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GCNT1Q02742 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCNT1Q02742 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCNT1Q02742 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCNT1Q02742 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCNT1Q02742 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCNT1Q02742 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCNT1Q02742 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCNT1Q02742 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCNT1Q02742 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCNT1Q02742 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCNT1Q02742 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCNT1Q02742 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCNT1Q02742 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCNT1Q02742 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCNT1Q02742 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCNT1Q02742 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCNT1Q02742 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCNT1Q02742 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCNT1Q02742 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCNT1Q02742 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCNT1Q02742 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCNT1Q02742 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GCNT1Q02742 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GCNT1Q02742 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GCNT1Q02742 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCNT1Q02742 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCNT1Q02742 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCNT1Q02742 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCNT1Q02742 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCNT1Q02742 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms