Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OC90Q02509 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OC90Q02509 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OC90Q02509 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
OC90Q02509 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OC90Q02509 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
OC90Q02509 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OC90Q02509 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
OC90Q02509 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OC90Q02509 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OC90Q02509 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OC90Q02509 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OC90Q02509 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OC90Q02509 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OC90Q02509 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OC90Q02509 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OC90Q02509 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OC90Q02509 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OC90Q02509 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OC90Q02509 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OC90Q02509 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OC90Q02509 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
OC90Q02509 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OC90Q02509 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OC90Q02509 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OC90Q02509 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OC90Q02509 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OC90Q02509 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
OC90Q02509 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OC90Q02509 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OC90Q02509 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OC90Q02509 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OC90Q02509 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OC90Q02509 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OC90Q02509 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OC90Q02509 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OC90Q02509 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OC90Q02509 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OC90Q02509 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OC90Q02509 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OC90Q02509 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OC90Q02509 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OC90Q02509 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
OC90Q02509 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OC90Q02509 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OC90Q02509 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OC90Q02509 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
OC90Q02509 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
OC90Q02509 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
OC90Q02509 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OC90Q02509 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OC90Q02509 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OC90Q02509 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OC90Q02509 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OC90Q02509 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OC90Q02509 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OC90Q02509 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OC90Q02509 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OC90Q02509 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OC90Q02509 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OC90Q02509 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OC90Q02509 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OC90Q02509 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OC90Q02509 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
OC90Q02509 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OC90Q02509 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OC90Q02509 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OC90Q02509 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OC90Q02509 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OC90Q02509 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OC90Q02509 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OC90Q02509 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OC90Q02509 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OC90Q02509 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OC90Q02509 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OC90Q02509 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OC90Q02509 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OC90Q02509 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OC90Q02509 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OC90Q02509 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OC90Q02509 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
OC90Q02509 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OC90Q02509 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OC90Q02509 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OC90Q02509 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OC90Q02509 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OC90Q02509 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OC90Q02509 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OC90Q02509 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OC90Q02509 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
OC90Q02509 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OC90Q02509 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OC90Q02509 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OC90Q02509 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
OC90Q02509 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OC90Q02509 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OC90Q02509 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OC90Q02509 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OC90Q02509 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OC90Q02509 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms